药学专升本《文献检索》课程简介

课程名称：文献检索              

学时数：20    

课程内容：本课程以传授信息检索知识、培养信息意识和初步检索技能，使学生具有自学能力和独立研究能力为教学目的。通过教学要求学生了解信息检索的基础知识和基本原理。掌握网络检索的原理和方法，网络检索数据库主要包括中国生物医学文献检索数据库CBMweb、中国知网、万方数据库、PubMed、Web of Science及多种搜索引擎的使用。 为将来能全、准、快地获取国内外医学信息打下基础。

推荐教材：郭继军主编，医学文献检索与论文写作，人民卫生出版社，2018年8月。

参考书目：《医学文献检索》，北京大学医学出版社，2010年版

             《医学文献检索与利用》，苏州大学出版社,2011年版

             《医学文献检索》，北京大学医学出版社，2010年版

学生成绩评定方法：开卷考试，考勤占总成绩的20%，平时作业占总成绩的10%，上机考试占总成绩的70%。

药学专升本《文献检索》教学大纲

一、前 言

本课程以传授信息检索知识、培养信息意识和初步检索技能，使学生具有自学能力和独立研究能力为教学目的。通过教学要求学生了解信息检索的基础知识和基本原理。掌握网络检索的原理和方法，网络检索数据库主要包括中国生物医学文献检索数据库SinoMed、中国知网、万方数据库、PubMed、Web of Science及多种搜索引擎的使用。 为将来能全、准、快地获取国内外医学信息打下基础。

教学基本要求

1、系统地、完整地掌握信息检索基本原理，提高学生的信息意识，为科技创新提供知识。

2、准确地掌握各检索工具的检索技巧。

二、教学内容及学时分配

本课程总时数为20学时，其中课堂讲授12学时，上机实习8学时（见附表）。

三、教学内容及要求

第一章   医学信息学的基础知识

一、目的和要求  

（一）了解文献的类型、概念；信息检索的概念和基本原理；检索语言；网络信息检索方法与步骤，初步树立情报意识。

（二）掌握文献的概念、文献检索的概念和检索的通用技巧。

二、教学内容

（一）信息、知识、情报与文献的概念及相互关系；文献载体不同的类型；重点介绍文献的各种分类方法。

（二）信息检索的概念和基本原理，情报意识的概念和培养，检索语言概念和种类。

（三）网络信息检索方法与步骤，评价检索效果的方法。

第二章  SinoMed及上机操作

一、目的和要求  

（一）掌握各种运算并能控制逻辑检索式；

（二）掌握“快速检索”“高级检索”“主题检索”“分类检索””期刊检索”“作者检索” 等指令检索文献；

（三）掌握检索结果“显示”和“结果输出”指令的使用方法

二、教学内容

（一）SinoMed数据库的研制单位，首版年份，收录范围；

（二）数据库的结构和内容，介绍篇名、著者姓名、文献来源、文摘、医学主题词字段；

（三）各种运算符，重点介绍and、or、in的使用方法以及逻辑检索式的制定；

（四）各种检索入口；

⑴“高级检索”指令下进行：①限定条件检索；②指定字段检索；③逻辑检索式检索；

⑵“主题检索”指令的使用方法；

⑶“分类检索”指令的使用方法；

⑷“期刊检索”指令的使用方法；

⑸“作者检索”指令的使用方法；

（五）检索结果的获取途径：

⑴ 显示检索结果及改变显示选择的方法；

⑵ 结果输出及改变输出形式的方法；

（六）提高查全率、查准率的方法。

第三章 中国知网数据库、万方数据库、维普数据库及上机操作

一、目的和要求  

（一）掌握中国知网、万方数据系统、维普数据网的网址；

（二）掌握这三种数据库的检索方法。

二、教学内容

（一）三大中文网络数据库的收录区别。

（二）关键词检索及其优化检索、高级检索、限定条件检索、索取文摘和全文的方法。

（三）熟悉期刊导航的检索方法。

（四）了解期刊目录浏览检索的方法。

第四章 PubMed及上机操作

一、目的和要求  

（一）掌握NCBI的网址、进入PubMed的方法；

（二）掌握各种运算并能控制逻辑检索式；

（三）掌握“基本检索”“高级检索”“主题检索”“限定条件检索” 等指令检索文献；

（四）掌握检索结果“显示”和“结果输出”指令的使用方法

二、教学内容

（一）PubMed开发单位、收录期刊开始年份

（二）输入检索词的有关规定∶①逻辑算符要大写，②作者姓名检索，③双引号短语检索，④刊名检索用全称或缩写，⑤字段检索时字段标识符置于方括号内，⑥复合检索时检索式号前要加#号⑦截词符*的用法。

（三）字段检索段方法

（四）限制检索条件的用法

（五）检索结果的显示、输出

（六）检索史的查看方法

（七）外链索取全文的方法，相关文献显示和索取方法

（八）显示、下载题录、文摘、全文的方法。

（九）了解PubMed的自动匹配功能。

第五章 Web of Science及上机操作

一、目的和要求  

（一）掌握引文数据库的概念

（二）掌握Web of Science的网址、收录范围。

（三）掌握各种运算并能控制逻辑检索式；

二、教学内容

（一）Web of Science的出版单位、收录期刊范围、子库名称。

（二）熟悉常用字段限定检索方法、逻辑运算符应用、检索结果处理。

（三）熟悉基本检索、作者检索、被引参考文献检索、高级检索及检索历史的使用方法。

（四）了解化学结构检索功能。

习     题

一、 概论思考题

1．简述文献检索的定义。

2．简述文献信息资源类型的划分。

3．简述文献数据库的检索途径。

4．主题语言有几种？简要阐述其特点。

5．什么是查全率和查准率，二者之间有何关系？

6．简述常用的文献检索技术。

7．试述扩大检索范围、提高查全率的方法。

二、  SinoMed练习题

1、检索2015-2017年二甲双胍在治疗65岁以上老年人糖尿病过程中可能出现的不良反应的文献。

2、检索肺动脉高压的主题词、上位主题词和下位主题词，并加权检索有关肺动脉高压流行病学的文献。

3、检索浙江大学医学院附属第一医院厉有名教授以第一作者发表的题名中含有非酒精性脂肪性肝病的文献。

4、中华医学会浙江分会出版的期刊有几种？列出其中至今发文数最多的期刊刊名、创刊年和ISSN号，并检索该刊2017年发表的有关高血压的文献。

5、检索发表在核心期刊上的摘要或关键词中含有阑尾炎的综述文献，结果按相关度排序。

6、阅读背景材料，提炼关键词，拟定一个主题，制定检索策略，检索相关参考文献。

2型糖尿病（type 2 diabetes, T2DM）是一种以胰岛β细胞分泌不足为特征的多因素疾病，除了饮食习惯和生活方式的变化外，遗传基因的变异也是2型糖尿病的重要危险因素。既往研究表明，有两个家族参与细胞内锌水平的调节：一个是ZnT（锌转运体）家族，由基因SLC30A编码；另一个是ZIP（锌结合蛋白）家族，由基因SLC39A编码。其中锌转运体8（zinc transporter 8，ZnT8）是ZnT家族成员新近发现的重要成员之一，定位于胰岛β细胞和少量α细胞中，为胰岛特异性的锌转运蛋白，它被认为是胰岛β细胞特异的锌转运体，在胰岛素的分泌、合成及储存过程中发挥着不可或缺的作用。但ZnT8 与2型糖尿病的相关性及作用机制有待更多的研究证实。  

三、  CNKI、万方、维普练习题（除第5题外，每道题目每个全文库都练习一遍）

1.四川大学华西药学院的张志荣在华西药学杂志上发表的文献

2.检索miR-146a(miRNA-146a、microRNA-146a)在胃癌细胞中表达及功能的研究文献

3.找出我国研究癌症疫苗的高产研究机构及高产作者。

4.检索核心期刊上发表的复方中药脑尔康治疗老年性痴呆的的文献。

5.检索运动对糖尿病的影响方面的学位论文，找出论文数最多的学位授予单位、学位年度、被引次数最多的学位论文的标题和作者。(CNKI,万方)

6.检索有关“内皮素和一氧化氮对肺移植早期缺血再灌注损伤的作用机制”的文献。

四、    Pubmed练习题

1、检索杂志《新英格兰医学杂志》（The New England Journal of Medicine）近五年以来发表的论文。

2、检索杂志《细胞》（cell）发表的综述论文。

3、作者Kaplan GG 发表在LANCET杂志上的文献。

4、检索高血压与吸烟的关系的文献（ hypertension、smoker、smoking、smoked）（提示：截词符）

5、检索作者John William Smith(smith jw)发表的论文标题中含癌症治疗（cancer、neoplasms、treatment、 therapy）方面的文献。

6、温州医科大学作者瞿佳老师的文献，语种为英文。

7、主题词：找出vitamin C 的主题词，以及其上位主题词和下位主题词。

8、主题词：找出先天性心脏病（Congenital heart disease ）的主题词。

9、主题检索：儿童（Child: birth-18 years）哮喘(asthma)的药物治疗(drug therapy)的英文综述文献。

10、主题检索：检索2003-09年期间关于霉酚酸在肾功能不全治疗的综述文献。

11、主题检索：检索2000年以来有关“65岁以上老人阿尔茨海默病（Alzheimer Disease）死亡率（mortality）的综述（Review）文献。

12、Journals Database检索（Journals in NCBI Databases）：PubMed中收录关于糖尿病(diabetes )的期刊有多少种？从中找出Journal of diabetes and treatment 杂志的缩写，期刊号、出版国、出版频率（提示：出版频率：旬刊？月刊？双月刊？季刊？半年刊？）

13、Single Citation Matcher检索：一篇文章发表在一期刊上，具体信息如下：2018, volume 173, issue7, and began on page 1573. 请利用PubMed查出这篇文章的第一作者及通讯地址。

五、   Web of Science核心合集

1、什么是引文数据库？web of science核心合集有哪些子库？

2、什么是期刊影响因子？《science》2015年影响因子是多少？

3、检索我校在2015至今在SCI中共发表多少篇文献？分析检索结果，哪种期刊发文量最多？哪个研究方向发文量最多？哪位作者发文量最多？

4、被引文献检索：标题：MICRORNAS IN DEVELOPMENT AND DISEASE；作者：Sayed, D (Sayed, Danish)；来源出版物:PHYSIOLOGICAL REVIEWS 卷:91 期:3 页:827-887。查询该论文被哪个杂志引用最多？哪个年份引用最多？哪个领域引用最多？

5、2017年，《Science》报道首项小神经胶质细胞大规模表征研究：科学家Gosselin David、Skola Dylan首次表征了大脑小神经胶质细胞（Microglia）（一种免疫防御细胞）的特异性分子标记，研究证据表明，小神经胶质细胞很可能在帕金森（Parkinson's disease）神经病变中扮演重要角色。我们知道小胶质细胞（microglia）是大脑的免疫细胞，但是它们在大脑中的作用仍未能阐明，Salk遗传学实验室教授Rusty Gage说，我们的新发现不仅将它们与疾病关联起来，还为有关小胶质细胞的基础生命科学研究提供了跳板。

根据以上材料分析：

（1）针对划线部分在SCI中查找有关该研究的论文题录信息，写出标题、作者、来源

（2）请在文中划线部分提取关键词在SCI中检索发表在2012-2016年相关的文献（请写出提取的关键词、检索表达式、检索数量、以及第一条记录的标题和第一作者）；被引用次数最多的是哪一篇文献？